Yo no me voy a arriesgar tanto en decir que es 100% seguro, pero en principio sí.
Me explico: que el mensaje se guarde o no, depende
únicamente de tu teléfono, no del mensaje en sí. En todos los móviles que he tenido a lo largo de los anhos los mensajes quedan guardados (parece la opción más lógica, no?) pero en el hipotético caso de que tu teléfono se pueda configurar para desechar automáticamente los mensajes una vez leídos prefiero comentar la posibilidad antes que decirte "sí, siempre"

En resumen... El mensaje se guarda. Si no es así es que has hecho algo raro.